Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVC0

C1orf146, Uncharacterized protein C1orf146, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf146Q5VVC0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf146Q5VVC0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf146Q5VVC0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1orf146Q5VVC0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1orf146Q5VVC0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1orf146Q5VVC0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf146Q5VVC0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf146Q5VVC0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf146Q5VVC0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf146Q5VVC0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms