Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01545Q5VT33 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms