Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SAMD5Q5TGI4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD5Q5TGI4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD5Q5TGI4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms