Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC38Q502W7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC38Q502W7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms