Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIF1AQ16665 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIF1AQ16665 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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