Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPARCL1Q14515 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPARCL1Q14515 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPARCL1Q14515 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms