Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCGB2A2Q13296 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCGB2A2Q13296 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms