Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBBP4Q09028 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RBBP4Q09028 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP4Q09028 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms