Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFI35P80217 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFI35P80217 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFI35P80217 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFI35P80217 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFI35P80217 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFI35P80217 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFI35P80217 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFI35P80217 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFI35P80217 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFI35P80217 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFI35P80217 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFI35P80217 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFI35P80217 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
IFI35P80217 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFI35P80217 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFI35P80217 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IFI35P80217 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFI35P80217 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFI35P80217 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFI35P80217 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFI35P80217 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFI35P80217 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFI35P80217 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFI35P80217 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFI35P80217 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFI35P80217 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFI35P80217 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFI35P80217 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFI35P80217 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFI35P80217 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFI35P80217 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFI35P80217 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFI35P80217 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFI35P80217 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFI35P80217 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFI35P80217 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFI35P80217 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFI35P80217 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFI35P80217 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFI35P80217 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFI35P80217 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFI35P80217 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFI35P80217 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFI35P80217 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFI35P80217 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFI35P80217 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFI35P80217 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFI35P80217 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFI35P80217 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFI35P80217 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFI35P80217 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFI35P80217 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFI35P80217 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFI35P80217 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFI35P80217 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFI35P80217 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFI35P80217 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFI35P80217 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFI35P80217 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFI35P80217 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFI35P80217 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFI35P80217 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFI35P80217 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFI35P80217 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFI35P80217 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFI35P80217 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFI35P80217 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFI35P80217 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFI35P80217 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFI35P80217 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFI35P80217 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFI35P80217 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFI35P80217 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFI35P80217 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFI35P80217 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFI35P80217 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFI35P80217 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFI35P80217 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFI35P80217 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFI35P80217 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFI35P80217 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFI35P80217 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFI35P80217 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFI35P80217 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFI35P80217 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFI35P80217 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFI35P80217 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFI35P80217 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFI35P80217 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFI35P80217 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFI35P80217 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFI35P80217 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFI35P80217 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFI35P80217 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFI35P80217 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFI35P80217 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFI35P80217 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFI35P80217 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFI35P80217 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms