Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2FP61218 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2FP61218 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms