Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCD1P59942 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCCD1P59942 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCCD1P59942 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms