Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRPF1P55201 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRPF1P55201 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms