Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCAN1P53805 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCAN1P53805 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RCAN1P53805 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCAN1P53805 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCAN1P53805 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCAN1P53805 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RCAN1P53805 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RCAN1P53805 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN1P53805 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN1P53805 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms