Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGGT1BP53609 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGT1BP53609 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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