Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC3P51654 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC3P51654 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC3P51654 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC3P51654 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC3P51654 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC3P51654 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC3P51654 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC3P51654 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC3P51654 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC3P51654 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC3P51654 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC3P51654 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC3P51654 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPC3P51654 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC3P51654 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC3P51654 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC3P51654 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC3P51654 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC3P51654 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC3P51654 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC3P51654 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC3P51654 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC3P51654 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC3P51654 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC3P51654 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC3P51654 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC3P51654 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC3P51654 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC3P51654 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC3P51654 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC3P51654 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC3P51654 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC3P51654 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC3P51654 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC3P51654 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC3P51654 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC3P51654 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC3P51654 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC3P51654 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC3P51654 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC3P51654 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC3P51654 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC3P51654 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC3P51654 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC3P51654 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC3P51654 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC3P51654 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC3P51654 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC3P51654 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC3P51654 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC3P51654 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC3P51654 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC3P51654 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC3P51654 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC3P51654 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC3P51654 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC3P51654 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC3P51654 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC3P51654 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC3P51654 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC3P51654 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC3P51654 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC3P51654 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC3P51654 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC3P51654 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC3P51654 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC3P51654 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC3P51654 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC3P51654 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC3P51654 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC3P51654 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC3P51654 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC3P51654 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC3P51654 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC3P51654 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC3P51654 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC3P51654 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC3P51654 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC3P51654 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC3P51654 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC3P51654 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC3P51654 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC3P51654 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC3P51654 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC3P51654 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC3P51654 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC3P51654 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC3P51654 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC3P51654 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC3P51654 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC3P51654 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC3P51654 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC3P51654 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC3P51654 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC3P51654 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC3P51654 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC3P51654 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC3P51654 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC3P51654 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms