Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCG1P45844 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms