Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 YNL234WYNL234W 1281 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 snR34snR34 203 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 MMR1YLR190W 1476 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 HFI1YPL254W 1467 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 LPL1YOR059C 1353 nt5.93□□□□□ -1.46
VFA1P40080 SPO77YLR341W 1434 nt5.92□□□□□ -1.46
VFA1P40080 IMG2YCR071C 441 nt5.92□□□□□ -1.46
VFA1P40080 KRE9YJL174W 831 nt5.92□□□□□ -1.46
VFA1P40080 YKL031WYKL031W 414 nt5.92□□□□□ -1.46
VFA1P40080 SPC24YMR117C 642 nt5.92□□□□□ -1.46
VFA1P40080 WTM1YOR230W 1314 nt5.92□□□□□ -1.46
VFA1P40080 AIM3YBR108W 2844 nt5.91□□□□□ -1.46
VFA1P40080 RAM1YDL090C 1296 nt5.91□□□□□ -1.46
VFA1P40080 GLO2YDR272W 825 nt5.91□□□□□ -1.46
VFA1P40080 HSP150YJL159W 1242 nt5.91□□□□□ -1.46
VFA1P40080 PML1YLR016C 615 nt5.91□□□□□ -1.46
VFA1P40080 YMR114CYMR114C 1107 nt5.91□□□□□ -1.46
VFA1P40080 YDL034WYDL034W 345 nt5.9□□□□□ -1.46
VFA1P40080 AAD6YFL056C 639 nt5.9□□□□□ -1.46
VFA1P40080 CDC43YGL155W 1131 nt5.9□□□□□ -1.46
VFA1P40080 THI4YGR144W 981 nt5.9□□□□□ -1.46
VFA1P40080 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.9□□□□□ -1.46
VFA1P40080 MND2YIR025W 1107 nt5.9□□□□□ -1.46
VFA1P40080 YPR195CYPR195C 330 nt5.9□□□□□ -1.46
VFA1P40080 ARR3YPR201W 1215 nt5.9□□□□□ -1.46
VFA1P40080 DED81YHR019C 1665 nt5.9□□□□□ -1.47
VFA1P40080 HER2YMR293C 1395 nt5.9□□□□□ -1.47
VFA1P40080 PDC1YLR044C 1692 nt5.89□□□□□ -1.47
VFA1P40080 QCR6YFR033C 444 nt5.89□□□□□ -1.47
VFA1P40080 NQM1YGR043C 1002 nt5.89□□□□□ -1.47
VFA1P40080 PIN2YOR104W 849 nt5.89□□□□□ -1.47
VFA1P40080 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.89□□□□□ -1.47
VFA1P40080 RPT1YKL145W 1404 nt5.89□□□□□ -1.47
VFA1P40080 SMF3YLR034C 1422 nt5.89□□□□□ -1.47
VFA1P40080 ATG32YIL146C 1590 nt5.89□□□□□ -1.47
VFA1P40080 HRP1YOL123W 1605 nt5.88□□□□□ -1.47
VFA1P40080 YDR541CYDR541C 1035 nt5.88□□□□□ -1.47
VFA1P40080 SCP1YOR367W 603 nt5.88□□□□□ -1.47
VFA1P40080 UBC4YBR082C 447 nt5.88□□□□□ -1.47
VFA1P40080 SAS4YDR181C 1446 nt5.88□□□□□ -1.47
VFA1P40080 COX26YDR119W-A 201 nt5.87□□□□□ -1.47
VFA1P40080 UPS3YDR185C 540 nt5.87□□□□□ -1.47
VFA1P40080 VMA16YHR026W 642 nt5.87□□□□□ -1.47
VFA1P40080 MTF1YMR228W 1026 nt5.87□□□□□ -1.47
VFA1P40080 SNN1YNL086W 309 nt5.87□□□□□ -1.47
VFA1P40080 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.87□□□□□ -1.47
VFA1P40080 YOL035CYOL035C 303 nt5.87□□□□□ -1.47
VFA1P40080 MRPL36YBR122C 534 nt5.87□□□□□ -1.47
VFA1P40080 NMD5YJR132W 3147 nt5.86□□□□□ -1.47
VFA1P40080 RAT1YOR048C 3021 nt5.86□□□□□ -1.47
VFA1P40080 SSZ1YHR064C 1617 nt5.86□□□□□ -1.47
VFA1P40080 RTN1YDR233C 888 nt5.86□□□□□ -1.47
VFA1P40080 YGR022CYGR022C 330 nt5.86□□□□□ -1.47
VFA1P40080 YLL059CYLL059C 507 nt5.86□□□□□ -1.47
VFA1P40080 IRS4YKR019C 1848 nt5.85□□□□□ -1.47
VFA1P40080 YHR045WYHR045W 1683 nt5.85□□□□□ -1.47
VFA1P40080 CWC21YDR482C 408 nt5.85□□□□□ -1.47
VFA1P40080 MRP17YKL003C 396 nt5.85□□□□□ -1.47
VFA1P40080 MSA2YKR077W 1092 nt5.85□□□□□ -1.47
VFA1P40080 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.85□□□□□ -1.47
VFA1P40080 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.85□□□□□ -1.47
VFA1P40080 YML131WYML131W 1098 nt5.85□□□□□ -1.47
VFA1P40080 MRPL22YNL177C 930 nt5.85□□□□□ -1.47
VFA1P40080 FES1YBR101C 873 nt5.85□□□□□ -1.47
VFA1P40080 GEP3YOR205C 1671 nt5.85□□□□□ -1.47
VFA1P40080 YEL028WYEL028W 462 nt5.84□□□□□ -1.47
VFA1P40080 COS9YKL219W 1224 nt5.84□□□□□ -1.47
VFA1P40080 SEN34YAR008W 828 nt5.84□□□□□ -1.47
VFA1P40080 VTA1YLR181C 993 nt5.84□□□□□ -1.47
VFA1P40080 PPA2YMR267W 933 nt5.84□□□□□ -1.47
VFA1P40080 NDJ1YOL104C 1059 nt5.84□□□□□ -1.47
VFA1P40080 HXK2YGL253W 1461 nt5.83□□□□□ -1.48
VFA1P40080 FOL1YNL256W 2475 nt5.83□□□□□ -1.48
VFA1P40080 RPT4YOR259C 1314 nt5.83□□□□□ -1.48
VFA1P40080 snR57snR57 88 nt5.83□□□□□ -1.48
VFA1P40080 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.83□□□□□ -1.48
VFA1P40080 CAD1YDR423C 1230 nt5.83□□□□□ -1.48
VFA1P40080 SUA5YGL169W 1281 nt5.83□□□□□ -1.48
VFA1P40080 DPH2YKL191W 1605 nt5.83□□□□□ -1.48
VFA1P40080 CTF18YMR078C 2226 nt5.83□□□□□ -1.48
VFA1P40080 PPR1YLR014C 2715 nt5.83□□□□□ -1.48
VFA1P40080 SNT2YGL131C 4212 nt5.82□□□□□ -1.48
VFA1P40080 MPC54YOR177C 1395 nt5.82□□□□□ -1.48
VFA1P40080 YAP1801YHR161C 1914 nt5.82□□□□□ -1.48
VFA1P40080 VTC2YFL004W 2487 nt5.82□□□□□ -1.48
VFA1P40080 EDC1YGL222C 528 nt5.82□□□□□ -1.48
VFA1P40080 YKR041WYKR041W 753 nt5.82□□□□□ -1.48
VFA1P40080 DCN1YLR128W 810 nt5.82□□□□□ -1.48
VFA1P40080 SSP120YLR250W 705 nt5.82□□□□□ -1.48
VFA1P40080 YBL070CYBL070C 321 nt5.82□□□□□ -1.48
VFA1P40080 RPC19YNL113W 429 nt5.82□□□□□ -1.48
VFA1P40080 TAX4YJL083W 1815 nt5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms