Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERPINF1P36955 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms