Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP2P32456 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP2P32456 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP2P32456 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP2P32456 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP2P32456 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP2P32456 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP2P32456 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP2P32456 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP2P32456 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP2P32456 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP2P32456 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP2P32456 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP2P32456 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP2P32456 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP2P32456 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP2P32456 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP2P32456 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP2P32456 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP2P32456 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP2P32456 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP2P32456 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP2P32456 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP2P32456 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP2P32456 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP2P32456 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP2P32456 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP2P32456 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP2P32456 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP2P32456 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP2P32456 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP2P32456 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP2P32456 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP2P32456 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP2P32456 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP2P32456 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP2P32456 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP2P32456 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP2P32456 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP2P32456 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP2P32456 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP2P32456 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP2P32456 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP2P32456 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP2P32456 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP2P32456 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP2P32456 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP2P32456 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP2P32456 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP2P32456 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP2P32456 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP2P32456 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP2P32456 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP2P32456 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP2P32456 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP2P32456 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP2P32456 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP2P32456 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP2P32456 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP2P32456 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP2P32456 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP2P32456 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP2P32456 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP2P32456 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP2P32456 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP2P32456 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP2P32456 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GBP2P32456 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP2P32456 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP2P32456 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP2P32456 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP2P32456 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP2P32456 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP2P32456 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP2P32456 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP2P32456 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP2P32456 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP2P32456 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP2P32456 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP2P32456 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP2P32456 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP2P32456 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP2P32456 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP2P32456 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP2P32456 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP2P32456 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP2P32456 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP2P32456 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP2P32456 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP2P32456 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP2P32456 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP2P32456 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP2P32456 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP2P32456 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP2P32456 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP2P32456 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP2P32456 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP2P32456 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP2P32456 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP2P32456 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms