Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
HOXA10P31260 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXA10P31260 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXA10P31260 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms