Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2CP19387 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms