Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF44P15621 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF44P15621 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF44P15621 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms