Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PABPC1P11940 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PABPC1P11940 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPC1P11940 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms