Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNC2P02585 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNC2P02585 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNC2P02585 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms