Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRPF40AO75400 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF40AO75400 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF40AO75400 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms