Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCO2O43819 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCO2O43819 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCO2O43819 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCO2O43819 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCO2O43819 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCO2O43819 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCO2O43819 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCO2O43819 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCO2O43819 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCO2O43819 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCO2O43819 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCO2O43819 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCO2O43819 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCO2O43819 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCO2O43819 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCO2O43819 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCO2O43819 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCO2O43819 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCO2O43819 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCO2O43819 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCO2O43819 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCO2O43819 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCO2O43819 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCO2O43819 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCO2O43819 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCO2O43819 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCO2O43819 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCO2O43819 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCO2O43819 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCO2O43819 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCO2O43819 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCO2O43819 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCO2O43819 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCO2O43819 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCO2O43819 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCO2O43819 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCO2O43819 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCO2O43819 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCO2O43819 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCO2O43819 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCO2O43819 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCO2O43819 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCO2O43819 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCO2O43819 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCO2O43819 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCO2O43819 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCO2O43819 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCO2O43819 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCO2O43819 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCO2O43819 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCO2O43819 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCO2O43819 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCO2O43819 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCO2O43819 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCO2O43819 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCO2O43819 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCO2O43819 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCO2O43819 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCO2O43819 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCO2O43819 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCO2O43819 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCO2O43819 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCO2O43819 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCO2O43819 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCO2O43819 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCO2O43819 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCO2O43819 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCO2O43819 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCO2O43819 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCO2O43819 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCO2O43819 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCO2O43819 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCO2O43819 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCO2O43819 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCO2O43819 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCO2O43819 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCO2O43819 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCO2O43819 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCO2O43819 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCO2O43819 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCO2O43819 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCO2O43819 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCO2O43819 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCO2O43819 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCO2O43819 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCO2O43819 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms