Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUX1O43812 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUX1O43812 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUX1O43812 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUX1O43812 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DUX1O43812 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUX1O43812 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUX1O43812 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUX1O43812 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUX1O43812 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DUX1O43812 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUX1O43812 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUX1O43812 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUX1O43812 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUX1O43812 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUX1O43812 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUX1O43812 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUX1O43812 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUX1O43812 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUX1O43812 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUX1O43812 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUX1O43812 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUX1O43812 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUX1O43812 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUX1O43812 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUX1O43812 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUX1O43812 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUX1O43812 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUX1O43812 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUX1O43812 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUX1O43812 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUX1O43812 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DUX1O43812 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUX1O43812 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUX1O43812 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUX1O43812 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUX1O43812 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX1O43812 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DUX1O43812 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUX1O43812 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUX1O43812 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUX1O43812 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUX1O43812 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
DUX1O43812 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX1O43812 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX1O43812 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX1O43812 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX1O43812 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX1O43812 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX1O43812 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX1O43812 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX1O43812 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX1O43812 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX1O43812 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUX1O43812 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUX1O43812 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUX1O43812 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DUX1O43812 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUX1O43812 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DUX1O43812 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUX1O43812 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUX1O43812 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUX1O43812 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUX1O43812 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUX1O43812 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUX1O43812 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUX1O43812 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUX1O43812 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUX1O43812 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUX1O43812 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUX1O43812 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUX1O43812 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX1O43812 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX1O43812 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX1O43812 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX1O43812 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX1O43812 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX1O43812 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX1O43812 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX1O43812 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX1O43812 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX1O43812 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX1O43812 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX1O43812 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX1O43812 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms