Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DENRO43583 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DENRO43583 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DENRO43583 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DENRO43583 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DENRO43583 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DENRO43583 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DENRO43583 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DENRO43583 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DENRO43583 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DENRO43583 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DENRO43583 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DENRO43583 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DENRO43583 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DENRO43583 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DENRO43583 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DENRO43583 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DENRO43583 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DENRO43583 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DENRO43583 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DENRO43583 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DENRO43583 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DENRO43583 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DENRO43583 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DENRO43583 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DENRO43583 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DENRO43583 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DENRO43583 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DENRO43583 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DENRO43583 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DENRO43583 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DENRO43583 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DENRO43583 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DENRO43583 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DENRO43583 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DENRO43583 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DENRO43583 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DENRO43583 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DENRO43583 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DENRO43583 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DENRO43583 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DENRO43583 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DENRO43583 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DENRO43583 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DENRO43583 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DENRO43583 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DENRO43583 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DENRO43583 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DENRO43583 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DENRO43583 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DENRO43583 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DENRO43583 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DENRO43583 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DENRO43583 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DENRO43583 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DENRO43583 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DENRO43583 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DENRO43583 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DENRO43583 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DENRO43583 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DENRO43583 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DENRO43583 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DENRO43583 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DENRO43583 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DENRO43583 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DENRO43583 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DENRO43583 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DENRO43583 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DENRO43583 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DENRO43583 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DENRO43583 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DENRO43583 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DENRO43583 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DENRO43583 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DENRO43583 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DENRO43583 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DENRO43583 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DENRO43583 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DENRO43583 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DENRO43583 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DENRO43583 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DENRO43583 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DENRO43583 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DENRO43583 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DENRO43583 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DENRO43583 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DENRO43583 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DENRO43583 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms