Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMAD6O43541 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD6O43541 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD6O43541 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms