Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRN3P2A6NIE6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRN3P2A6NIE6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRN3P2A6NIE6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRN3P2A6NIE6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RRN3P2A6NIE6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRN3P2A6NIE6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRN3P2A6NIE6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRN3P2A6NIE6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRN3P2A6NIE6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRN3P2A6NIE6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RRN3P2A6NIE6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRN3P2A6NIE6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRN3P2A6NIE6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3P2A6NIE6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms