Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C9orf170A2RU37 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf170A2RU37 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms