Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN7Q9Y6W3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN7Q9Y6W3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN7Q9Y6W3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms