Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF6Q9Y252 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms