Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC2Q9Y235 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBEC2Q9Y235 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC2Q9Y235 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms