Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD4AQ9UPU9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SAMD4AQ9UPU9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SAMD4AQ9UPU9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.2 ms