Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCTPQ9UKL6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCTPQ9UKL6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms