Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BATF3Q9NR55 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BATF3Q9NR55 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms