Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CWC22Q9HCG8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CWC22Q9HCG8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC22Q9HCG8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms