Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL25A1Q9BXS0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL25A1Q9BXS0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COL25A1Q9BXS0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL25A1Q9BXS0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms