Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF4Q9BQW3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF4Q9BQW3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF4Q9BQW3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms