Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN18Q96SJ8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN18Q96SJ8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN18Q96SJ8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms