Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERGIC2Q96RQ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERGIC2Q96RQ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERGIC2Q96RQ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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