Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD4Q96M96 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD4Q96M96 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms