Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2E2Q96LR5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E2Q96LR5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms