Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDLIM2Q96JY6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDLIM2Q96JY6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDLIM2Q96JY6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms