Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC11Q96J66 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCC11Q96J66 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ABCC11Q96J66 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 287.6 ms