Protein–RNA interactions for Protein: Q96HV5

TMEM41A, Transmembrane protein 41A, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41AQ96HV5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM41AQ96HV5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM41AQ96HV5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM41AQ96HV5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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