Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX27Q96GQ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX27Q96GQ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX27Q96GQ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms