Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATRIPQ8WXE1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATRIPQ8WXE1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATRIPQ8WXE1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms