Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAP2Q8IXW5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RPAP2Q8IXW5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms